Vzorčenje oceanske DNA

Craig Venter, eden od pionirjev in veliko ime na področju genomike, je s sodelavci objavil natančnejše rezultate analize DNA, ki so jo izolirali iz vzorcev mikroorganizmov, zbranih med plovbo po oceanih. Venter je svojo 30 metrsko jahto Sorcerer II dal predelati v raziskovalno ladjo in nato dve leti z drobnimi mrežami lovil plankton, iz njega izoliral DNA in analiziral najdena zaporedja. Rezultati seveda ne omogočajo natančne analize vrst organizmov, ker pa je plankton doslej slabo raziskan na ravni DNA, so se lahko pohvalili, da so skupaj našli zapise za več kot 6 milijonov novih proteinov! Ekspedicija za vzorčenje svetovnih oceanov ima svojo spletno stran, na kateri natančno opisujejo pot okrog sveta, način vzorčenja (po 200 litrov vode so filtrirali skozi vedno bolj drobna sita in filtre z ujetimi organizmi zamrznili do ekstrakcije DNA) in ponujajo skoraj 400 MB skomprimiranih rezultatov. V obliki treh člankov je del rezultatov danes objavljen v reviji PLoS Biology, osnovne podatke pa sem povzel po sporočilu agencije Reuters.